Este forma în care scheletul se află în interiorul corpului, fiind întâlnit la Cordate, Echinoderme şi Bureţi (Porifera).
Acest schelet asigură stabilitatea şi ţinuta corpului asigurând mobilitatea organismului.
Scheletul cordatelor şi echinodermelor provine din mezoderm (din faza de embriogeneză fiind una dintre cele tre straturi embrionale: Endoderm, Mesoderm şi Ectoderm).